Os peritos do Departamento de Polícia Técnica informaram que ela foi morta com três tiros nas costas e um na cabeça. Ao lado do corpo foram encontrados projéteis de calibres variados.
O mon compte betclic delegado Alberto Passos de Melo, que fez o levantamento cadavérico, afirmou que já existe uma pista que pode levar aos assassinos de Rafaela. Na tarde de segunda-feira algumas jovens estiveram em sua casa, no bairro Minas Gerais, ameaçando a menina de morte, mas a motivação do crime ainda está sendo apurada. O assassinato pode ter ocorrido por volta das 22h30 de segunda (5). Neste horário moradores ouviram barulhos de arma de fogo. Mas o corpo só foi encontrado por volta das 2h30 da madrugada por pessoa que estavam indo para o trabalho. A mãe de Rafaela foi surpreendida com a morte da filha já por volta das 06h, quando chegava da lavoura de café. Conforme ela, Rafaela participava de um grupo de danças da cidade.